Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Grin2cQ01098 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Grin2cQ01098 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms