Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pde1bQ01065 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms