Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrcdQ00LT2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PrcdQ00LT2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
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