Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Serpina1cQ00896 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms