Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga4Q00651 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms