Protein–RNA interactions for Protein: P97770

Thumpd3, THUMP domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd3P97770 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd3P97770 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms