Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas2P97460 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas2P97460 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas2P97460 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Npas2P97460 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Npas2P97460 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Npas2P97460 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npas2P97460 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms