Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lig3P97386 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lig3P97386 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig3P97386 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig3P97386 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig3P97386 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig3P97386 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig3P97386 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig3P97386 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig3P97386 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig3P97386 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lig3P97386 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms