Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec1P97353 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec1P97353 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec1P97353 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec1P97353 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec1P97353 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec1P97353 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec1P97353 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec1P97353 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms