Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rps3aP97351 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rps3aP97351 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms