Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
PrkdcP97313 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrkdcP97313 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms