Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mesp1P97309 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms