Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx3P81067 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx3P81067 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx3P81067 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx3P81067 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx3P81067 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Irx3P81067 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Irx3P81067 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms