Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Tp53bp1P70399 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tp53bp1P70399 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tp53bp1P70399 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tp53bp1P70399 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tp53bp1P70399 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tp53bp1P70399 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tp53bp1P70399 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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