Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp9xP70398 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms