Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx1P70314 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pitx1P70314 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms