Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rad54lP70270 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rad54lP70270 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rad54lP70270 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54lP70270 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54lP70270 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54lP70270 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54lP70270 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54lP70270 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54lP70270 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54lP70270 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54lP70270 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54lP70270 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54lP70270 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54lP70270 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54lP70270 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54lP70270 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54lP70270 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54lP70270 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rad54lP70270 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms