Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn5P68500 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms