Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tubb4bP68372 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tubb4bP68372 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms