Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UbdP63072 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UbdP63072 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UbdP63072 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UbdP63072 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UbdP63072 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UbdP63072 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UbdP63072 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UbdP63072 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UbdP63072 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UbdP63072 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UbdP63072 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UbdP63072 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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UbdP63072 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UbdP63072 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
UbdP63072 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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UbdP63072 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UbdP63072 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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UbdP63072 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
UbdP63072 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UbdP63072 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UbdP63072 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UbdP63072 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UbdP63072 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
UbdP63072 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
UbdP63072 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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