Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Rps29P62274 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms