Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp46P62069 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Usp46P62069 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp46P62069 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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