Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Eif3eP60229 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms