Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csrnp3P59055 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csrnp3P59055 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms