Protein–RNA interactions for Protein: P58801

Ripk2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk2P58801 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ripk2P58801 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms