Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Paxbp1P58501 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Paxbp1P58501 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms