Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ctdsp1P58466 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ctdsp1P58466 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms