Protein–RNA interactions for Protein: P58281

Opa1, Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa1P58281 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opa1P58281 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Opa1P58281 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa1P58281 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa1P58281 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa1P58281 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa1P58281 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opa1P58281 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms