Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcstnP57716 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NcstnP57716 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NcstnP57716 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NcstnP57716 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms