Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn18P56857 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn18P56857 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms