Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SmoP56726 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmoP56726 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmoP56726 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmoP56726 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmoP56726 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmoP56726 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmoP56726 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmoP56726 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SmoP56726 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmoP56726 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmoP56726 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmoP56726 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmoP56726 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SmoP56726 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SmoP56726 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmoP56726 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SmoP56726 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmoP56726 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmoP56726 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmoP56726 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmoP56726 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmoP56726 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmoP56726 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmoP56726 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmoP56726 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmoP56726 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SmoP56726 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmoP56726 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmoP56726 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmoP56726 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmoP56726 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmoP56726 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmoP56726 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmoP56726 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmoP56726 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmoP56726 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmoP56726 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmoP56726 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmoP56726 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmoP56726 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmoP56726 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmoP56726 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmoP56726 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmoP56726 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmoP56726 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmoP56726 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmoP56726 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmoP56726 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmoP56726 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmoP56726 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmoP56726 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmoP56726 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SmoP56726 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SmoP56726 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmoP56726 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmoP56726 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmoP56726 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmoP56726 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmoP56726 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmoP56726 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SmoP56726 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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