Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux1P53564 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux1P53564 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux1P53564 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux1P53564 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux1P53564 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux1P53564 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux1P53564 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux1P53564 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux1P53564 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux1P53564 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux1P53564 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms