Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DbtP53395 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DbtP53395 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbtP53395 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbtP53395 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbtP53395 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbtP53395 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
DbtP53395 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbtP53395 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbtP53395 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbtP53395 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbtP53395 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbtP53395 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbtP53395 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbtP53395 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbtP53395 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbtP53395 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbtP53395 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbtP53395 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbtP53395 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
DbtP53395 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
DbtP53395 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
DbtP53395 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DbtP53395 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DbtP53395 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DbtP53395 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DbtP53395 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DbtP53395 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DbtP53395 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DbtP53395 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DbtP53395 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DbtP53395 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DbtP53395 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DbtP53395 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DbtP53395 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DbtP53395 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DbtP53395 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
DbtP53395 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
DbtP53395 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms