Protein–RNA interactions for Protein: P52950

Dbx1, Homeobox protein DBX1, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dbx1P52950 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Dbx1P52950 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Dbx1P52950 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Dbx1P52950 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dbx1P52950 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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