Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClgnP52194 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClgnP52194 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClgnP52194 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ClgnP52194 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClgnP52194 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClgnP52194 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms