Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Apobec1P51908 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms