Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TubP50586 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TubP50586 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TubP50586 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TubP50586 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TubP50586 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TubP50586 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TubP50586 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TubP50586 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TubP50586 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TubP50586 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TubP50586 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TubP50586 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TubP50586 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TubP50586 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TubP50586 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TubP50586 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TubP50586 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TubP50586 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TubP50586 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TubP50586 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TubP50586 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TubP50586 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TubP50586 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TubP50586 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TubP50586 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TubP50586 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TubP50586 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TubP50586 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TubP50586 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TubP50586 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TubP50586 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TubP50586 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TubP50586 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TubP50586 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TubP50586 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TubP50586 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TubP50586 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TubP50586 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TubP50586 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TubP50586 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TubP50586 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TubP50586 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TubP50586 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TubP50586 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TubP50586 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TubP50586 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TubP50586 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TubP50586 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TubP50586 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TubP50586 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TubP50586 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TubP50586 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TubP50586 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TubP50586 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TubP50586 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TubP50586 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TubP50586 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TubP50586 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TubP50586 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TubP50586 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TubP50586 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TubP50586 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TubP50586 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TubP50586 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TubP50586 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TubP50586 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TubP50586 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms