Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SftpbP50405 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpbP50405 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpbP50405 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SftpbP50405 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpbP50405 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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SftpbP50405 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SftpbP50405 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SftpbP50405 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SftpbP50405 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SftpbP50405 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SftpbP50405 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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