Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CitP49025 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CitP49025 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CitP49025 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CitP49025 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CitP49025 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CitP49025 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CitP49025 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CitP49025 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CitP49025 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CitP49025 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CitP49025 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CitP49025 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CitP49025 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CitP49025 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CitP49025 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CitP49025 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CitP49025 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CitP49025 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CitP49025 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CitP49025 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CitP49025 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CitP49025 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CitP49025 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CitP49025 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CitP49025 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CitP49025 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CitP49025 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CitP49025 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CitP49025 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CitP49025 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CitP49025 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CitP49025 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CitP49025 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CitP49025 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CitP49025 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CitP49025 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CitP49025 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CitP49025 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CitP49025 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CitP49025 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CitP49025 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CitP49025 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CitP49025 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CitP49025 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CitP49025 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CitP49025 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CitP49025 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CitP49025 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CitP49025 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CitP49025 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CitP49025 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CitP49025 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CitP49025 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CitP49025 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CitP49025 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CitP49025 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CitP49025 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CitP49025 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CitP49025 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CitP49025 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CitP49025 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CitP49025 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CitP49025 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CitP49025 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CitP49025 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CitP49025 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CitP49025 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CitP49025 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.9 ms