Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gli1P47806 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gli1P47806 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gli1P47806 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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