Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrprbP47758 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrprbP47758 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrprbP47758 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrprbP47758 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrprbP47758 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrprbP47758 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrprbP47758 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrprbP47758 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SrprbP47758 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrprbP47758 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrprbP47758 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms