Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdkn1bP46414 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms