Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sipa1P46062 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sipa1P46062 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms