Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprkP35822 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprkP35822 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprkP35822 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PtprkP35822 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprkP35822 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprkP35822 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprkP35822 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprkP35822 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PtprkP35822 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprkP35822 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms