Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms