Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rom1P32958 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rom1P32958 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rom1P32958 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rom1P32958 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rom1P32958 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rom1P32958 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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