Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pabpc1P29341 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms