Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms