Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprmP28828 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprmP28828 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprmP28828 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprmP28828 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprmP28828 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprmP28828 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprmP28828 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PtprmP28828 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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