Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrbP28704 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrbP28704 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RxrbP28704 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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